Re: Создание анимации реакции
По идее изначально ChemCraft вроде затачивался на такие программы, как Gaussian, GAMESS.
Их файлы сканирования ChemCraft открывает как надо, может попробовать конвертировать в них, а потом анимировать одной кнопкой?
В предыдущий версиях ChemCraft файлы природы вообще открывались последней структурой, не было точек оптимизации.
Сейчас смотрю Gaussian-ановский файл, на каждом шаге оптимизации выводится энергия.
Формат файла оптимизции Gaussian (главные ключевые слова, которые читает ChemCraft):
Entering Gaussian System, xxx
--------------------------
#... Opt Freq
--------------------------
Input orientation:
---------------------------------------------------------------------
Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms)
Number Number Type X Y Z
---------------------------------------------------------------------
1 6 0 -1.028011 0.401116 -0.797487
2 6 0 -1.743611 0.839270 -2.057499
...
---------------------------------------------------------------------
Standard orientation:
---------------------------------------------------------------------
Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms)
Number Number Type X Y Z
---------------------------------------------------------------------
1 6 0 -2.316480 0.765431 -0.082040
2 6 0 -2.312348 -0.747888 -0.042794
...
---------------------------------------------------------------------
... следующий шаг ...
Input orientation:
---------------------------------------------------------------------
Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms)
Number Number Type X Y Z
---------------------------------------------------------------------
1 6 0 -1.028011 0.401116 -0.797487
2 6 0 -1.743611 0.839270 -2.057499
...
---------------------------------------------------------------------
Standard orientation:
---------------------------------------------------------------------
Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms)
Number Number Type X Y Z
---------------------------------------------------------------------
1 6 0 -2.316480 0.765431 -0.082040
2 6 0 -2.312348 -0.747888 -0.042794
...
---------------------------------------------------------------------
Пробелы перед строками важны!