Внимание!

Мы используем cookie для сохранения в вашем браузере информации о ваших предыдущих посещениях. Это необходимо для более удобной работы с сайтом.
Если Вы с этим не согласны, вы можете отключить использование cookie в настройках браузера.
Принять

Бейдеровский анализ зарядов

  • В этой теме 1 ответ, 2 участника, последнее обновление 13 лет назад сделано oxchem.
Просмотр 2 сообщений - с 1 по 2 (из 2 всего)
Хранитель
Zheka
Хранитель

Источник: HenkelmanGroup
ПО для анализа, умеющее обрабатывать файлы Gaussian/GAMESS: Bader Charge Analysis

Кто что думает о методах оценки распределения зарядов на атомах и о Бейдеровском анализе в частности?

Участник
oxchem
Участник
Zheka писал(а):
Источник: HenkelmanGroup
ПО для анализа, умеющее обрабатывать файлы Gaussian/GAMESS: Bader Charge Analysis

Из бесплатных можно добавить AIMALL (Я не нашёл GUI) , TopMoD, InteGriTy, Extreme 94 &MORPHY (давно не обновлялось). Gau$$ian не очень подходит для этих целей. причём не только в случаях молекул со сложной электронной структурой и/или циклами. Например, для CH3OCH2CH3 G03 считает, что H-атом 4-х валентный (менял функционалы, базисы). см. ниже

****** ZERO-FLUX SURFACE  6 ETA0  -0.281080 ******

NUCLEI  7  (это терминальный Н-атом) 4 BOND POINT COORDS    -4.428665    5.712973  -0.259440

GRID OF 820 POINTS (100.0 % OF THE FULL GRID) USED

ITERATION  1    RMS ERROR  0.4881355410E-02
WARNING: RMS ERROR HAS INCREASED
ITERATION  2    RMS ERROR  0.5583459135E-02
WARNING: RMS ERROR HAS INCREASED
NEWTON STEP FAILED FOR SURFACE SHEET  6
Error termination via Lnk1e in D:G03Wl609.exe at Thu Jul 10 23:36:54 2008.

Для link609 программисты (Ciolkovsky et all) оставили достаточно управляющих параметров, менял их, но успеха не достиг. В aimall всё прошло быстро и просто.

Zheka писал(а):
Кто что думает о методах оценки распределения зарядов на атомах и о Бейдеровском анализе в частности?

Существует мнение, что заряды Bader (AIM) и Hirshfeld дают результаты  наиболее близкие к обычным химическим предсталениям.

Просмотр 2 сообщений - с 1 по 2 (из 2 всего)

Для ответа в этой теме необходимо авторизоваться.

abcdefghijklmnopqrstuvwxyz абвгдеёжзийклмнопрстуфхцчшщьыъэюя
abcdefghijklmnopqrstuvwxyz абвгдеёжзийклмнопрстуфхцчшщьыъэюя
Сменить аватар
Секретный вопрос
<%= q %>
Наложить бан
Пользователь
USER
Сделать предупреждение
Пользователю
USER