Внимание!

Мы используем cookie для сохранения в вашем браузере информации о ваших предыдущих посещениях. Это необходимо для более удобной работы с сайтом.
Если Вы с этим не согласны, вы можете отключить использование cookie в настройках браузера.
Принять

Квантовохимическая программа Orca

Просмотр 9 сообщений - с 16 по 24 (из 24 всего)
Участник
SeriousSem
Участник
Мне не надо распаралеливать на 8 ядер через сеть. просто на 2 ядра core duo 2 процессора

Собственно о том и речь, сетевой протокол (ssh или rsh) используется независимо от того, два ли это ядра (или больше) у одного процессора или несколько компьютеров в одной сети.

Профайл — это который лежит в домашнем каталоге, например /home/user/.profile , его и надо редактировать.

что значит эта строчка export PATH=$PATH:$ORCA

Этой строкой экспортируется путь к каталогу с ORCA, чтобы при запуске расчета управляющйе файл знал, где ему брать бинарники для запуска очередной процедуры.

О настройке ssh информация есть здесь (см. соотв. ссылки):

http://hp.parallel.ru/parBB/viewtopic.php?f=3&t=96

Участник
catal
Участник

спасибо попробую сделать

Участник
la421
Участник

Здравствуйте! Я начал разбираться с оркой, скачал версию для винды. При выводе графика орбиталей (MO…) все работает хорошо, и можно даже посмотреть молекелом 4.3. Но если я пишу в файле вывести eldens или spindens, то даже расчет не начинается. В выходном файле, после слов о том на кого мне надо сослаться в моей статье, следует надпись LEAVING ORCA. Кто-нибудь сталкивался с подобной проблемой?

Участник
oxchem
Участник
la421 писал(а):
Здравствуйте! Я начал разбираться с оркой, скачал версию для винды. При выводе графика орбиталей (MO…) все работает хорошо, и можно даже посмотреть молекелом 4.3. Но если я пишу в файле вывести eldens или spindens, то даже расчет не начинается. В выходном файле, после слов о том на кого мне надо сослаться в моей статье, следует надпись LEAVING ORCA. Кто-нибудь сталкивался с подобной проблемой?

Если я правильно помню, то для указанных Вами действий ORCA пытается вызвать внешнюю программу (сообщение LEAVING ORCA) , например, AIMPACK from Bader. Но не находит ёё и аварийно завершает работу.

Участник
Asthinus
Участник

Друзья!

Нужна ваша помощь. Кто-нибудь проводил IRC расчёты при помощи ORCA? В документации ничего подобного не нашёл, быть может, в ORCA не реализована подобная процедура?!

Участник
oxchem
Участник
Asthinus писал(а):
Друзья!

Нужна ваша помощь. Кто-нибудь проводил IRC расчёты при помощи ORCA? В документации ничего подобного не нашёл, быть может, в ORCA не реализована подобная процедура?!

ЭтОЙ функции нет в ORCA.

Участник
Asthinus
Участник

А ещё знаете, чего я не нашёл в документации? Как поменять температуру для расчёта термохимии 🙂 А в лучшем случае, надо бы при нескольких температурах функции состояния посчитать…

Кто-нибудь может мне помочь?!

Участник
Asthinus
Участник

Ребята,

а у меня ещё есть вопрос к знающим людям. Нужно провести скан в орке сразу по двум координатам. Во входном файле пишу строки:
%geom
   scan
      B 0 10 = 2.331, 4.331, 21
      B 0 9 = 2.333, 4.333, 21
   end
end

Программа вылетает с ошибкой:
Error: you have specified 2 parameters to be scanned (in COORDS/PARDEF)
       The maximum number of scan-parameters is 3!

В чём подвох?

Участник
Asthinus
Участник

Как мне сообщил многоуважаемый профессор Dr. Frank Neese, который собственно и возглавляет группу создателей Орки, термохимический расчёт пока проводится для температуры 298.15 К, так как программа находится на стадии разработки, и в будущем будет добавлена соответствующая опция. Что касается IRC: в данный момент ребята как раз работают над этим; сложность кодирования процедуры IRC, как сказал гер профессор, связана с тем фактом, что в Орке используется численный гессиан, вместо аналитического. Я продолжаю поддерживать контакт с профессором Neese и буду держать Вас, дорогие коллеги, в курсе событий.

Просмотр 9 сообщений - с 16 по 24 (из 24 всего)

Для ответа в этой теме необходимо авторизоваться.

abcdefghijklmnopqrstuvwxyz абвгдеёжзийклмнопрстуфхцчшщьыъэюя
abcdefghijklmnopqrstuvwxyz абвгдеёжзийклмнопрстуфхцчшщьыъэюя
Сменить аватар
Секретный вопрос
<%= q %>
Наложить бан
Пользователь
USER
Сделать предупреждение
Пользователю
USER