Спасибо! Я как раз вчера сканированием занимался (просто интересно было дооптимизировать это соединение, поэтому с ним возился, по координате я тоже сканировал из найденых максимумов, вот только переходное состояние не искал).

Не подскажите ответ на вопросов по входным файлам:
Зачем при расчёте гессиана после всех секций приводить энергию?
...
$molecule
z-matrix
...
$end
Energy =   -784.12379607

Это как-то используется в ходе расчёта и влияет на сам расчёт?

upd.: Понял причину моих проблем с оптимизацией ClAlMe2. Просто я раньше округлял расстояния и углы в z-матрице до 3-го знака после запятой, т.к. не считал последующие цифры значимыми. Но при решении колебательной задачи в данном случае они, как оказалось, имеют значение.