Эта строка никак не влияет. Просто она, видимо, есть в MOL-файлах, содержащих оптимизированные геометрии предыдущих расчетов, их я не глядя вставлял в следующий инпут. (MOL-файлы у меня делает скрипт-обработчик аутпута из строк, помеченных MOL>).