трансмиссионный коэффициент в определённом смысле подгоночный параметр канонической теории пер. состояния. Включает в себя — коэффициент туннелирования, коэффициент рекроссинга, коэффициент отклонения функции распределения от равновесной функции распределения.
Что именно Вы хотите рассчитать с помощью Gaussian? 😉 и траекторных расчетов?
Как именно можно сделать с применением программы G? я не знаю, но знаю, что в известном смысле, различные статистические теории являются противовесом к траекторному моделированию, так как задают свои аппроксимирующие функции.

Я имею небольшой опыт работы с программой MultiWell. тАМ можно вычислять поправку на туннелирование, если иметь *.out-файлы G03.

имеет смысл найти программу, которая могла бы рассчитывать коэфф. тунн. (таких я видел много, но не работал с ними). И в зависимости от их входных данных выбирать вид моделирования на Гауссиан.

BOMD, указанный в Help, и IOP, вроде бы, не позволяют провести вычисления коэффициента туннелирования.