Продолжаю тестировать ПРИРОДУ для кластера.

I. В процедуре оптимизации (сканирования и т.п.) прироста производительности не обнаружено (а даже наоборот). Оперативная память самую малость распараллеливается (значение для первого узла, а оно самое большое, примерно одинаковое во всех вариантах, т.е. выгода невелика), а потребление дисковой памяти полностью сосредоточено на первом узле.

Задача: DFT (PBE/3z), Zr2, Al3, Cl2, C44, H79; оптимизация

1. На 2-х ядрах (1 узел)
Memory used =   107 029 KB
Memory used =    32 442 KB
  Disk  used =   811 182 KB,      14 773 456 KB written,     66 365 288 KB read
  Disk  used =        0 KB,             2 KB written,            0 KB read
Message passing statistics:
node     sent KB   # msg    time          received      time
    0    30234122  366073    73.9    25761513  963746   304.6
    1    25761513  963746    76.7    30234122  366073   728.0

2. На 8-и ядрах (4 узла)
Memory used =    94 766 KB
Memory used =    25 559 KB
...
Memory used =    25 559 KB
  Disk  used =   811 201 KB,      18 497 655 KB written,     78 747 400 KB read
  Disk  used =        0 KB,             2 KB written,            0 KB read
...
  Disk  used =        0 KB,             2 KB written,            0 KB read
Message passing statistics:
node     sent KB   # msg    time          received      time
    0    53269440  454057   561.2    17257456  661811   395.0
    1    11075766  482633   619.3    15052323  355237  1286.7
...
    7    11310920  482314   429.8    15300961  354899  1334.9

II. В расчёте колебательной задачи замечен 2-х кратный прирост скорости (при 4-х кратном увеличении ядер).

Задача: DFT (PBE/3z), Zr, Cl2, C10 H10; расчёт гессиана

1. На 2-х ядрах (1 узел)
Memory used =    23 345 KB
Memory used =    12 768 KB
  Disk  used =   234 324 KB,        645 398 KB written,      2 951 768 KB read
  Disk  used =        0 KB,             0 KB written,            0 KB read
Message passing statistics:
node     sent KB   # msg    time          received      time
    0     2157531   17472     3.1     1520214   68422     5.9
    1     1520214   68422     8.7     2157531   17472    27.3

CPU  time =  297.93 sec =  4.97 min = 0.08 hr =   99.90%
CPU  time =  297.11 sec =  4.95 min = 0.08 hr =   99.63%
REAL time =  298.22 sec =  4.97 min = 0.08 hr
ratio     =  199.53%

2. На 8-и ядрах (4 узла)
Memory used =    23 239 KB
Memory used =    12 747 KB
...
Memory used =    12 759 KB
  Disk  used =   234 330 KB,        645 405 KB written,      2 952 143 KB read
  Disk  used =        0 KB,             0 KB written,            0 KB read
...
  Disk  used =        0 KB,             0 KB written,            0 KB read
Message passing statistics:
node     sent KB   # msg    time          received      time
    0     3239874   34037    23.9      991254   35091    33.9
    1      439625   32600    33.9      670417   11288    24.9
...
    7      466563   32492    29.4      688652   11195    24.9

CPU  time =  143.69 sec =  2.39 min = 0.04 hr =   99.96%
CPU  time =  143.10 sec =  2.39 min = 0.04 hr =   99.55%
...
CPU  time =  143.11 sec =  2.39 min = 0.04 hr =   99.56%
REAL time =  143.74 sec =  2.40 min = 0.04 hr
ratio     =  796.38%