Внимание!

Мы используем cookie для сохранения в вашем браузере информации о ваших предыдущих посещениях. Это необходимо для более удобной работы с сайтом.
Если Вы с этим не согласны, вы можете отключить использование cookie в настройках браузера.
Принять

Zheka

Просмотр 15 сообщений - с 31 по 45 (из 90 всего)
В ответ на: Квантовохимическая программа ПРИРОДА

Зацените:

Priroda 8 (2008.09.05)
copyright (c) D.N. Laikov

date: Mon Oct 13 04:41:09 2008

parallel on  8 processors
node  0: 'cluster.uimech.org'
node  1: 'node-2'
node  2: 'node-3'
node  3: 'node-5'
node  4: 'cluster.uimech.org'
node  5: 'node-2'
node  6: 'node-3'
node  7: 'node-5'

Memory: 256m (256m) + 768m

oxchem писал(а):
Я не утверждал,  что механизм данной реакции является одностадийным. Я лишь пример приводил.

Я тоже не утверждал, что Вы утверждали, что механизм данной реакции является одностадийным.
Я лишь человека, задавшего вопрос, пугал 🙂

Точно, системы похоже не такие уж и маленькие, а механизмы образования этих веществ многостадийные.

В ответ на: Квантовохимическая программа ПРИРОДА

Вручную правил вклад симметрии во вращательную поправку к Энтропии. Проверил сегодня параметр sigma в группе $thermo. Расчитанные значения совпадают с ручной правкой.

А правка заключается всего-лишь в вычитании от энтропии R*ln S, где S — число симметрии.
Как определяется это число можно посмотреть в презентации по термохимии у Сергея Леонидовича Хурсана.

В ответ на: Квантовохимическая программа ПРИРОДА

Похоже, что установленные ограничения на дисковую память во входном файле действуют только на один процесс ПРИРОДЫ. И если указать disk=10 и запустить ПРИРОДУ на 4-х ядрах, то может быть занято до 40 ГБ.

С оперативной памятью пока не понятно. Она же разделяемая (shared memory), значит должна указываться одна на все процессы? Или я ошибаюсь.

В ответ на: Квантовохимическая программа ПРИРОДА

Хартри-Фок-Рутаан (task=HF) с релятивистским гамильтонианом (лямбда-базисы из basis4.in) не работает, зависает.

Также зависает вычисление хим. сдвигов ЯМР в случае релятивистского гамильтониана при всех базисах и методах. Хим. сдвиги у меня получалось расчитывать только в случае нерялитивистского DFT (всякие MP2 и т.п. не выводят значения хим. сдвигов).

В ответ на: Квантовохимическая программа Gaussian

А зачем именно гау$$иан? Расчитываются какие-то специфические задачи?
Есть бесплатные не менее функциональные замены.

В ответ на: Квантовохимическая программа Gaussian

Лицензионный гауссиан в России не продаётся (можно заказать только по почте за много кило$).

В ответ на: Квантовохимическая программа Gaussian
Юлия писал(а):
Сообщите, пожалуйста:
1) Есть ли русифицированная версия программ Gaussian;

В природе такого не существует.

Юлия писал(а):
2) Можно ли где-то посмотреть demo-версию, прежде чем покупать лицензию?
Спасибо заранее!

Если только в том месте, где уже куплена лицензия.

В ответ на: Квантовохимическая программа ПРИРОДА
Tarquinn писал(а):
Вот часть вывода команды (после избавления от большей части очевидного мусора)

Да, я эти команды видел. Только надо проверять, что из этого работает.

В ответ на: Квантовохимическая программа ПРИРОДА

В пакете Priroda полно всяких разных незадокументрированных функций. Кто какие знает?

Если указать в качестве task=extremal, то начинается вроде как экстремальная оптимизация (если это то, что я думаю, то после каждого шага оптимизации должен считаться гессиан).

В ответ на: g03 и PAE-support
Yurii писал(а):
Вы очень суровы к Gaussian'у.

Я имел в виду не общую скорость работы, а стиль разработки этого пакета.
Ошибок там очень много, и никто не спешит их исправлять (как мне кажется).
А также стиль работы самой Gaussian Inc. (трудности с покупкой дистрибутива и растаможкой коробочки, которую они присылают. Особенно эта проблема стоит у не-Московских институтов).

А по задачам — на каких-то быстрее/лучше/удобнее работает Gaussian, на каких-то GAMESS.

В ответ на: g03 и PAE-support
Yurii писал(а):
Не поддерживает. Я работаю с исходным кодом gaussin и, в зависимости от настроек и среды выполнения, могу создать g03 под IA32, EM64T или IA64.

А как-же отличие в версиях для AMD64 и EM64T?
На сайте гауссиана писали, что создали отдельную версию под EM64T.

В ответ на: g03 и PAE-support

Точно не знаю, но думаю вряд ли Gaussian поддерживает PAE.
И вообще, до недавнего времени я считал, что PAE лишь ОС поддерживает, расширяет доступную память. А у ПО как был максимальный объем доступной памяти (если только 2 копии процесса не запускать), так и остаётся.

Тем более, что Gaussian — малоповоротливая программа. В 32-битной версии применяют старинную схему адрессации данных в файлах, поэтому ограничение на один файл 2000 МБ. Gaussian Inc. — законченные неповоротливые буржуины-коммерсы.

В ответ на: Разные методы — разные значения
Yurii писал(а):
Вы мне расчет от PRIRODA пришлите.

Пришлите, пришлите, во вложении 😉
Старые файлы не сохранил, т.ч. про 2 часа можно мне верить на словах.
Во вложении уже более-менее оптимизированная молекула, можно посмотреть время 1 шага.

Просмотр 15 сообщений - с 31 по 45 (из 90 всего)
abcdefghijklmnopqrstuvwxyz абвгдеёжзийклмнопрстуфхцчшщьыъэюя
abcdefghijklmnopqrstuvwxyz абвгдеёжзийклмнопрстуфхцчшщьыъэюя
Сменить аватар
Секретный вопрос
<%= q %>
Наложить бан
Пользователь
USER
Сделать предупреждение
Пользователю
USER