Внимание!

Мы используем cookie для сохранения в вашем браузере информации о ваших предыдущих посещениях. Это необходимо для более удобной работы с сайтом.
Если Вы с этим не согласны, вы можете отключить использование cookie в настройках браузера.
Принять

Yurii

Просмотр 11 сообщений - с 1 по 11 (из 11 всего)
В ответ на: g03 и PAE-support
Zheka писал(а):
Я имел в виду не общую скорость работы, а стиль разработки этого пакета.
Ошибок там очень много, и никто не спешит их исправлять (как мне кажется).

Это Вам кажется. Сравнивать исходники gamess и gaussian — все равно, что сравнивать день и ночь. Для gaussian никакого Грановского не надо.

В ответ на: g03 и PAE-support
Zheka писал(а):
…Gaussian — малоповоротливая программа…

Вы очень суровы к Gaussian'у. Я на своем компе под EM64T (процессор q9450, рейд-массив из 4-х винчестеров) обсчитываю ситстему с 3780 базисными функциями (RHF/D95V, более 400 атомов, симметрия D3D). Один цикл в SCF итер. при этом занимает в среднем около 10 мин. Если считать, что одна SCF итер. состоит в среднем из 12 циклов, то получаем вполне приемлемый результат. Вместо библиотеки Intel MKL я использую свою, что позволяет увеличить скорость счета до 30% (а для полуэмпирики и до всех 50%). Некоторые подробности можно узнать на моей странице.

В ответ на: g03 и PAE-support
Zheka писал(а):
А как-же отличие в версиях для AMD64 и EM64T?
На сайте гауссиана писали, что создали отдельную версию под EM64T.

У меня версия под IA32+IA64. В интернете можно найти, как должны быть модифицированы соответствующие файлы для перехода на EM64T.

В ответ на: g03 и PAE-support
oxchem писал(а):
Здравствуйте!

Хотелось бы узнать ответ на вопрос: есть ли у g03 (32bit on Linux) поддержка PAE (Physical Address Extension)… ?

Не поддерживает. Я работаю с исходным кодом gaussin и, в зависимости от настроек и среды выполнения, могу создать g03 под IA32, EM64T или IA64.

В ответ на: Разные методы — разные значения
Zheka писал(а):
про 2 часа можно мне верить на словах.

От конца первой итер. до конца 2-ой — 10 мин. при 410 б.ф. (см. вложение; проц. q9450, все 4 ядра загружены).
Необходимы идентичные расчеты с хронометражем времени, чтобы понять, где PRIRODA жульничает (у меня есть доступ к исходникам gaussian, поэтому мне легко это сделать).

В ответ на: Разные методы — разные значения
Zheka писал(а):
В PRIRODA он занимает не больше 2-х часов полностью…

Вы мне расчет от PRIRODA пришлите.

В ответ на: Разные методы — разные значения
Zheka писал(а):
…накопал из архивов..

А расчет?

В ответ на: Разные методы — разные значения
Zheka писал(а):
Не знаю такой истории, осетрина PRIRODA на моих задачах работает лучше, чем буржуйская Гауссиана.

Пришлите расчет в хорошем базисе и входной файл для Гауссиана. Что касается осетрины, то это я про симметрию (и не только).

В ответ на: Разные методы — разные значения
Zheka писал(а):
Использование симметрии резко сокращает проводимые расчёты.
Если сравнивать, то нужно сравнивать в одинаковых условиях (PRIRODA не учитывает симметрию при оптимизации и решении колебательной задачи).
Я не буду спорить с тем, если кто-нибудь скажет, что точность в PRIRODA меньше, чем в Gaussian. Однако абсолютно все тенденции DFT в PRIRODA совпадают с DFT в Gaussian.
Фуллерены C60 один из участников UQCS считает. И на Природу в общем-то не жаловался
(но это у него лично нужно спрашивать).

PS: Лично я в большинстве случаев изучаю несимметричные комплексы. И ускорения, применяемые в PRIRODA (использование основного и вспомогательного базиса DFT), очень сильно помогают.

Все это напоминает историю про осетрину второй (а может и n-ой, где n>2) свежести.

В ответ на: Разные методы — разные значения
oxchem писал(а):
Совершенно с Вами согласен. Одно только жаль, что далеко не все могут ощутить преимущества 64х-разрядной архитектуры, особенно, на gau$$ian (EM64T)

Основное преимущество EM64T — это возможность использования дополнительной ОП. Для вещественной арифметики никаких особых преимуществ по скорости нет. Например, на новых 45 нм. Intel'овских процессорах можно реализовать код gaussian под IA32 так, что он будет работать быстрей, чем gaussian под EM64T.

В ответ на: Разные методы — разные значения
Zheka писал(а):
…Зато DFT работает очень даже достойно. И по скорости, и главное, по затратам памяти.

Попробуйте сравнить DFT в Priroda с DFT/RI-DFT во всех остальных программах. И тогда тесты сразу встанут на место и будет видно, почему Природу хвалят…

Посчитайте методом DFT в приличном базисе C60 (симметрия Ih) Природой, а потом сделайте аналогичный расчет gaussian'ом под Linux'ом (EM64T). И у Вас отпадет всякая охота хвалить Природу.

Просмотр 11 сообщений - с 1 по 11 (из 11 всего)
abcdefghijklmnopqrstuvwxyz абвгдеёжзийклмнопрстуфхцчшщьыъэюя
abcdefghijklmnopqrstuvwxyz абвгдеёжзийклмнопрстуфхцчшщьыъэюя
Сменить аватар
Секретный вопрос
<%= q %>
Наложить бан
Пользователь
USER
Сделать предупреждение
Пользователю
USER